Der Botanische Verein zu Hamburg e. V. betreut eine Reihe von Naturdenkmalen (ND) und ist an der Betreuung von Naturschutzgebieten (NSG) und schutzwürdigen Gebieten in Landschaftsschutzgebieten (LSG) beteiligt.
Dies sind zur Zeit folgende Gebiete:
- NSG Duvenwischen
- ND Poppenbüttler Graben
- ND Sievertsche Tongrube
- NSG Boberger Niederung
- NSG Ammersbek-Niederung
- NSG Borghorster Elblandschaft
- NSG Duvenstedter Brook
- NSG Hummelsbütteler Moore
- NSG Lauenburger Elbvorland
- NSG Schnaakenmoor
- NSG Stapelfelder Moor
- NSG Talhänge bei Göttin
- NSG Volksdorfer Teichwiesen